南洋各地如此混乱的局势下，远东却很少参与其中。就算是根据局势的变化想要支持哪个势力，也是由南洋开发公司在幕后进行操作。情报部派出了大批的人员，在南洋各地进行活动，因为南洋开发公司建立的庞大地下势力的协助，远东情报部行动起来往往都很顺利。
虽然南洋各岛战乱纷飞，但远东控制区的附近，却是非常的平静。每年都有很多来自大明江南的百姓，被远东有计划的送到了南洋，然后接受远东的训练和整编，并且以中队、大队、支队的组织形式，在南洋各地进行屯田。
这些华人都是由郑芝龙、宋世平和刘香以各种手段弄来的，他们和远东的新移民一样，来到南洋的要接受净化，并接受一年的严格管理，并接受系统的冬训。
第二年他们也同样享受远东的包产到户政策，但南洋移民所需的资金和物资，全都由南洋开发公司来承担。南洋开发公司每年都能通过各种黑暗的地下交易，获得极为可观的利润。
每年远东还从冬训的移民中，挑选表现良好的人，作为远东的基层管理干部进行培养，把他们送到辽东进行学习和磨练，为今后进入大明做准备。
来到南洋的江南移民，也组建若干火枪民兵连，作为华人移民的基层武装力量。当然，远东驻守在南洋的军事力量非常强大，八个海外旅，一个敢死军联队，六个敢死军独立大队，以及大批的战斗、后勤支援部队。
南洋各地因为战乱和瘟疫，大批的土地荒无人烟。无数来自大明江南的移民，踩着南洋土著的累累白骨，占据了这些荒芜的土地。他们慢慢的蚕食着南洋的大批土地。虽然动作很慢，但这是一件长期的任务。今后将会持续几十年。
远东每当接收一片土地，就会对这个地区开展冷酷无情的“严打”行动，对这一地区残存的黑恶势力进行清算，彻底铲除这片地区的毒瘤。
使得未来的十几年里，南洋各地逐渐出现了冰火两重天的景象。一边战乱纷飞，瘟疫流行，土地荒芜，到处都弥漫着血雨腥风。而另一边的远东控制区。则是完全相反，到处都是安定祥和，阡陌纵横的田园风光。
各地四处逃难的南洋土著，都想进入远东的控制区，但他们绝大多数都被安置在远东控制区外面的难民营里，被南洋开发公司一批批的骗到“黑暗矿井”和“死亡农庄”里消耗掉。
少数有资格进来的南洋土著，大都是年轻漂亮的妇女以及各行各业的手艺人，但也会马上被船送到辽东。还有一些身体强壮的土著，则是被送到远东各地的矿区和工地从事苦工。
当然，在远东的各个矿区和工地。条件就好多了，虽然每天工作十几个小时，但是起码安全性能保证。每天也能吃上两顿饱饭。
但那些进入“黑暗矿井”和“死亡农庄”的南洋土著，那就没什么活路了。据后世历史学家研究，在1638年-1658年着二十年间，无数南洋土著青壮死在了“黑暗矿井”和“死亡农庄”里。
再加上大批死于战乱和瘟疫的南洋各地土著，这段时间南洋各地的土著折损了一半以上，而且这段时间南洋各地的生育率也急剧的下降，大批妇女莫名其妙的换上了不育之症。这二十年在南洋历史上被称为“黑暗的二十年”。
几十年后，南洋的华人人口已经占据了绝大多数，南洋的土著则是被分散安置在南洋各地。还有相当一部分被送到远东在世界各地的殖民地做苦工。
而南洋开发公司的规模也在逐渐扩大，后来又被拆分出了印度开发公司、美洲开发公司、澳大利亚开发公司、中东开发公司、非洲开发公司等十几个子公司。
只是这些公司的运作方式。就要温和多了，再没有出现南洋这样的惨剧发生。而且远东后来建国以后。对这段历史都是用各种方式极力的掩盖
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